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一、什么是蛋白质序列分析？ 蛋白质序列分析是指对蛋白质氨基酸序列及其特征区域（如信号肽、跨膜结构域、功能位点等）进行系统性的比对、注释、结构预测与功能推断。该过程通常基于以下几类分析方法： * 序列比对（如 BLAST、Clustal Omega）：用于发现与已知蛋白相似的序列，推测功能或家族归属；
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蛋白质是生命活动的直接执行者，其结构与功能高度依赖于氨基酸序列的精准表达。蛋白质测序（Protein Sequencing）技术作为连接基因组学与表型研究的重要桥梁，正在推动我们对生命系统的理解不断深入。蛋白质测序以高分辨率质谱为核心，通过对多肽片段的碎裂谱图分析，实现蛋白的全面定性与定量，并可同步
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蛋白质测序技术的历史，见证了现代生命科学从化学反应到系统组学的跨越。从最早期的Edman降解法，到如今以高分辨质谱为核心的蛋白组学平台，蛋白质测序的技术演进不断突破检测深度、通量与功能解析能力，为人类解码生命蓝图提供了坚实基础。本文回顾蛋白质测序的关键发展历程，并展望其在功能组学、个性化医疗和AI辅
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De Novo测序是指在没有任何已知序列信息或参考数据库的情况下，通过实验数据直接推断出一段生物分子（如DNA、RNA、蛋白质）的原始一级结构的技术。它是研究全新物种、新突变体、未知抗体、天然蛋白等生物样本时的关键方法。在蛋白质组学领域，De Novo测序是利用高分辨率质谱（MS/MS）对酶解后的多
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一、什么是SWATH-MS？ SWATH-MS是基于质谱数据独立采集（DIA）的一种技术，最早由SCIEX公司提出。与传统的DDA（Data Dependent Acquisition）方法相比，SWATH-MS并不依赖实时选择前体离子，而是将全扫描范围划分为一系列固定宽度的m/z窗口，并在每个窗口
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蛋白质是细胞活动的执行者，其功能取决于精确的氨基酸序列。一旦序列发生改变，蛋白的结构、相互作用和生物学功能都可能受到显著影响。蛋白质测序（Protein Sequencing）不仅有助于解析蛋白功能机制，更在疾病研究、抗体开发、新药靶点筛选等方面发挥着基础性作用。自20世纪中期以来，蛋白质测序技术不
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氨基酸序列是蛋白质功能的基石，亦是理解生物体调控机制、疾病发展与分子药物作用的关键入口。随着蛋白组学的迅速发展，氨基酸序列分析已经从传统化学测定拓展至高通量、可修饰、多维度的数据整合阶段，成为连接基因组与表型功能的重要桥梁。本文将探讨当前主流的氨基酸序列分析技术路径、常见挑战。 一、氨基酸序列分析
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无标记定量蛋白质组学（Label-Free Quantitative Proteomics, LFQ）技术，凭借其样本准备简便、适用范围广泛、无标签干扰等优势，正逐渐成为生命科学研究中重要的定量手段。尤其在系统生物学、疾病机制研究、生物标志物筛选及药物研发等领域，无标记定量策略正发挥着越来越重要的作
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在蛋白质组学快速发展的今天，质谱技术已成为揭示生命活动分子机制的核心工具之一。从早期的DDA（数据依赖采集）到近年来的DIA（数据独立采集），质谱方法不断进化，推动了蛋白组数据的深度、准确度与重现性。而在DIA技术体系中，SWATH-MS（Sequential Window Acquisition
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在蛋白质组学研究中，数据依赖于已有的蛋白质数据库进行谱图匹配。然而，在非模式物种研究、新蛋白修饰探索、单细胞蛋白组学以及抗体表征等前沿应用中，数据库往往无法提供足够支持。从头测序（de novo peptide sequencing）技术应运而生，成为解析未知蛋白序列的关键工具。 从头测序是一项高
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